GENETYCZNA DIAGNOSTYKA INFEKCJI DRÓG ODDECHOWYCH
Infekcje dróg oddechowych, są poważną przyczyną chorób i przypadków śmiertelnych na całym świecie; szczególnie u dzieci i osób starszych. Ocenia się, że schorzenia te są przedmiotem 1/4 wszystkich konsultacji lekarskich. Wśród nich są zarówno łagodnie przebiegające przeziębienia, jak i mogące kończyć się zgonem zapalenia płuc. Choroby te są też głównym czynnikiem zaostrzeń wielu innych schorzeń. Bezpośredni kontakt układu oddechowego ze światem zewnętrznym naraża go na atak patogenów obecnych w powietrzu. Najczęściej są nimi wirusy, do najgroźniejszych zaliczyć należy rhinowirusy, coronawirusy i adenowirusy. Nieco rzadsze są zakażenia bakteryjne, z pośród których dominują zapalenia pneumokokowe ( Streptococcus pneumoniae) oraz wywołane przez bakterię Haemophilus influenzae. Infekcje te rozprzestrzeniają się w populacji stosunkowo szybko i dotyczą całego społeczeństwa. Do zakażeń dochodzi drogą kropelkową podczas kontaktu z zakażoną osobą lub podczas zabiegów w szpitalach. Genetyczna diagnostyka infekcji dróg oddechowych pozwala na rozpoznanie czynnika chorobotwórczego na bardzo wczesnym etapie rozwoju choroby. Możliwe jest zatem szybkie zastosowanie specyficznego leczenia. Ilościowe oznaczenia pozwalają ponadto na monitorowanie przebiegu i skuteczności zastosowanego leczenia. Centrum Badań DNA oferuje następujące testy diagnostyczne:
POJEDYNCZE BADANIA:
104 Legionella pneumophila - test jakościowy, PCR
106 Streptococcus pneumoniae - test jakościowy, Real-Time PCR
108 Mycoplasma pneumoniae - test jakościowy, Real-Time PCR
120 Haemophilus influenzae - test jakościowy, Real-Time PCR
122 Chlamydophila pneumoniae - test jakościowy, Real-Time PCR
124 Bordetella pertussis - test jakościowy, PCR
PANELE BADAŃ:
712 Panel PNEUMO-BACTER 6 - identyfikacja 6 bakterii: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila, Bordetella pertussis, test jakościowy, multiplex PCR
713 Panel PNEUMO-VIRUS 12 - identyfikacja 12 wirusów: AdV, MPV, Coronavirus 229E, PIV1, PIV2, PIV3, FluA, FluB, RSVA, RSVB, Rhino, Coronavirus OC43, test jakościowy, multiplex PCR
714 Panel PNEUMO-TOTAL 18 - identyfikacja 12 wirusów i 6 bakterii: grypa A, grypa B, RSVA, RSVB, Coronavirus OC43/HKU1, Coronavirus 229E/NL63, Rhinowirus, AdV, MpV, paragrypa 1, paragrypa 2, paragrypa 3, Mycoplasma pneumoniae, Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila, Bordetella pertussis - test jakościowy multiplex PCR z rozdziałem w wysokiej rozdzielczości
|
122 Chlamydophila pneumoniae - test jakościowy, Real-Time PCR
Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Chlamydophila pneumoniae w wymazach z górnych dróg oddechowych. Bakteria ta przenoszona jest drogą kropelkową i jest uznanym czynnikiem etiologicznym zakażeń górnych i dolnych dróg oddechowych. Ponadto może rozprzestrzenić się do innych części ciała, w tym zainfekować tkankę nerwową, mózg, mięśnie, nerki, drogi moczowo - płciowe, wątrobę, stawy, nabłonek naczyń krwionośnych, jak i system immunologiczny. Bakterie te wywołują między innymi zapalenie płuc, oskrzeli, zatok, ucha i gardła. Ch. pneumoniae podejrzewana jest także o udział w patogenezie choroby wieńcowej, astmy, choroby Alzheimera, a nawet miażdżycy. Z wieloletnich obserwacji wynika, że osoby zainfekowane tą bakterią częściej niż inne przechodzą zawał serca, udar mózgu i cierpią na nadciśnienie oraz bóle stawów. Większość zakażeń to infekcje bezobjawowe lub o łagodnym przebiegu. Test ten charakteryzuje się bardzo wysoką czułością i swoistością. Pozwala stwierdzić nosicielstwo jak i aktywne zakażenie już w kilka dni po infekcji umożliwiając tym samym wczesne podjęcie leczenia.
| Materiał do badań: |
wymaz z jamy nosowo-gardłowej |
| Sposób przesyłania: |
zestaw do badań z dróg oddechowych |
| Metodyka badań: |
Real-Time PCR |
| Czas realizacji: |
do 7 dni roboczych |
124 Bordetella pertussis - jakościowo, PCR
Test polega na wykrywaniu DNA pałeczki krztuśca (Bordetella pertussis) w wymazie z jamy nosowo-gardłowej. Krztusiec jest obecnie rzadko występującą chorobą dzięki stosowaniu szczepień ochronnych. Badania wykazały jednak, że odporność poszczepienna przeciwko krztuścowi zanika po około 12 latach. Dlatego coraz więcej przypadków krztuśca pojawia się wśród dzieci w wieku szkolnym i u młodzieży. Na krztusiec chorują również dorośli, którzy już dawno stracili odporność poszczepienną, choroba przebiega u nich łagodniej niż u dzieci lub przyjmuje nietypową postać zapalenia oskrzeli. W przebiegu krztuśca pojawia się napadowy kaszel prowadzący do duszności. Przebycie krztuśca pozostawia trwałą odporność.
| Materiał do badań: |
wymaz z jamy nosowo-gardłowej, plwocina |
| Sposób przesyłania: |
temp. otoczenia (zestaw do wymazów z dróg oddechowych) |
| Metodyka badań: |
PCR |
| Czas realizacji: |
do 7 dni roboczych |
120 Haemophilus influenzae - jakościowo, PCR
Test polega na wykrywaniu DNA bakterii Haemophilus influenzae w wymazie z jamy nosowo-gardłowej lub we krwi. Haemophilus influenzae jest bakterią Gram ujemną, która może być fizjologicznym składnikiem mikroflory bakteryjnej górnych dróg oddechowych (nosicielstwo u dzieci 60-90%, u dorosłych 35%). Wyodrębniono 6 typów tej bakterii, oznaczonych literami od a do f. Bakteria ta jest jednym z najczęstszych czynników etioliologicznych zakażeń dróg oddechowych. Zakażenie przenoszone jest drogą kropelkową. Chorują głównie dzieci w wieku od 3 miesięcy do 3 lat. Zakażenie jest w większości przypadków wywoływane przez Haemophilus influenzae typu b. Choroba może przebiegać pod różnymi postaciami klinicznymi, np. jako zapalenie ucha środkowego, krtani, kości, stawów, osierdzia, czy też jako ropne zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych.
| Materiał do badań: |
wymaz z jamy nosowo-gardłowej, plwocina |
| Sposób przesyłania: |
temp. otoczenia (zestaw do wymazów z dróg oddechowych) |
| Metodyka badań: |
Real - Time PCR |
| Czas realizacji: |
do 7 dni roboczych |
104 Legionella pneumophila - jakościowo, PCR
Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Legionella pneumophila. Naturalnym rezerwuarem tych bakterii są zeutrofizowane wody powierzchniowe lub wilgotna gleba. Bakterie te kolonizują także sieć wodociągową, wodne urządzenia kąpielowe (prysznice, wanny, baseny) oraz klimatyzatory. Wywołują zakażenia układu oddechowego (za pośrednictwem aerozoli wytwarzanych w urządzeniach klimatyzacyjnych, prysznicach, saunach, itp.), które mogą przebiegać epidemicznie. U chorego bakterie wydalane są z plwociną, nie stwierdzono jednak przenoszenia zakażenia z człowieka na człowieka. Rodzaj Legionella obejmuje 49 gatunków, 80-90% zachorowań spowodowanych jest infekcją Legionella pneumophila. Legionelloza może występować pod kilkoma postaciami:
-choroba legionistów - postać z dominującymi objawami ciężkiego zapalenia płuc;
-gorączka Pontiac - postać pozapłucna, łagodna, grypopodobna;
-postać pozapłucna - ciężka, uogólniona, stan septyczny u chorych, m.in. po transplantacji nerek lub serca.
| Materiał do badań: |
wymaz z jamy nosowo-gardłowej, plwocina |
| Sposób przesyłania: |
temp. otoczenia (zestaw do wymazów z dróg oddechowych) |
| Metodyka badań: |
PCR |
| Czas realizacji: |
do 7 dni roboczych |
108 Mycoplasma pneumoniae, jakościowo, Real-Time PCR
Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Mycoplasma pneumoniae wywołującej mykoplazmozę. Objawy choroby są zróżnicowane, od lekkiego zakażenia górnych dróg oddechowych do ostrego zapalenia płuc, ponadto mogą jej towarzyszyć powikłania ze strony układu nerwowego, serca, stawów, albo trzustki, częste są objawy skórne w postaci wysypek, rumieni, wrzodziejącego zapalenia jamy ustnej czy zapalenia spojówek. Przebieg zakażenia mykoplazmatycznego u 10-20% osób może być bezobjawowy. W 60-80% przypadków przebiega jako zakażenie górnych dróg oddechowych lub zapalenie tchawicy i oskrzeli. W niektórych przypadkach może pojawić się zapalnie płuc lub powikłania ze strony układu nerwowego, serca, stawów i trzustki. Typowymi objawami infekcji jest niewielki wzrost temperatury, katar, bóle głowy i gardła, przewlekły, suchy kaszel. Do infekcji M. pneumoniae dochodzi głównie drogą kropelkową, jednak patogen ten jest również jedną z koinfekcji przenoszonych przez kleszcze.
| Materiał do badań: |
wymaz z jamy nosowo-gardłowej, plwocina, krew pełna (EDTA) |
| Sposób przesyłania: |
temp. otoczenia (zestaw do wymazów z dróg oddechowych), 4-10°C (zestaw do badań z krwi) |
| Metodyka badań: |
Real-Time PCR |
| Czas realizacji: |
do 7 dni roboczych |
712 Panel PNEUMO-BACTER 6 - identyfikacja 6 bakterii, jakościowo, multiplex PCR
Test obejmuje panel badań genetycznych polegających na wykrywaniu obecności DNA i identyfikacji gatunkowej 6 bakterii wywołujących infekcje dróg oddechowych, tj: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila i Bordatella pertussis. Test umożliwia identyfikację patogena sprawczego infekcji dróg oddechowych o etiologii bakteryjnej.
| Materiał do badań: |
wymaz z jamy nosowo-gardłowej |
| Sposób przesyłania: |
temp. otoczenia (zestaw do wymazów z dróg oddechowych) |
| Metodyka badań: |
multiplex PCR |
| Czas realizacji: |
od 2 do 7 dni roboczych |
713 Panel PNEUMO-VIRUS 12 - identyfikacja 12 wirusów, jakościowo, multiplex PCR
Test obejmuje panel badań genetycznych polegających na wykrywaniu obecności materiału genetycznego i identyfikacji 12 wirusów wywołujących infekcje dróg oddechowych, tj: AdV, MPV, Coronavirus 229E, PIV1, PIV2, PIV3, grypa typu A, grypa typu B, RSVB, RSVA, Rhino wirus i Coronavirus OC43. Test umożliwia identyfikację patogena sprawczego infekcji dróg oddechowych o etiologii wirusowej.
| Materiał do badań: |
wymaz z jamy nosowo-gardłowej |
| Sposób przesyłania: |
temp. otoczenia (zestaw do wymazów z dróg oddechowych) |
| Metodyka badań: |
multiplex PCR |
| Czas realizacji: |
od 2 do 7 dni roboczych |
714 Panel PNEUMO-TOTAL 18 - identyfikacja 13 wirusów i 5 bakterii, multiplex PCR z rozdziałem w wysokiej rozdzielczości
Test obejmuje panel badań genetycznych polegających na wykrywaniu obecności materiału genetycznego i identyfikacji 18 patogenów wywołujących infekcje dróg oddechowych, w tym: 13wirusów: wirus grypy A, wirus grypy B, RSVA, RSVB, Rhinovirus, Coronavirus OC43/HKU1, Coronavirus 229E/NL63, Adenovirus, wirus paragrypy 1, wirus paragrypy 2, wirus paragrypy 3, bocawirus i enterowirus) i 5 bakterii: Mycoplasma pneumoniae, Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae i Legionella pneumophila. Test umożliwia identyfikację patogenów sprawczych infekcji dróg oddechowych zarówno o etiologii wirusowej jak i bakteryjnej oraz ich rozróżnienie.
| Materiał do badań: |
wymaz z jamy nosowo-gardłowej |
| Sposób przesyłania: |
temp. otoczenia (zestaw do wymazów z dróg oddechowych) |
| Metodyka badań: |
multiplex PCR z rozdziałem w wysokiej rozdzielczości (sekwencjonowanie automatyczne) |
| Czas realizacji: |
od 2 do 7 dni roboczych |
|
|